医院是1912年由国家教育部创办的中国所国立高等医学院校——北京医学专门学校、 国立北平大学医学院附属医院发展而来，1937年在全民抗战的烽火中，为民族大义，为拯救和保存中国高等医学教育，迁陕重建，奠基并发展了西北地区的高等医学教育和现代临床医学，是西北所大学附属医院。
医院学科设置齐全，设有6个专科病院， 60个临床医技科室、以及多个科研实验机构、编辑部等其他业务部门。是国家疑难病症诊治能力提升工程项目资助单位、国家区域医疗中心建设及能力输出单位（呼吸与危重症医学科）；国家中西医协同“旗舰”医院试点项目建设单位；有生物诊断国家地方联合工程研究中心、全国医疗机构医学人工智能研究院、全国大数据算法与分析技术国家工程实验室；泌尿外科、皮肤科系国家重点学科；骨外科、消化内科、临床专科护理、地方病科(地方性骨病、心肌病、碘相关及甲状腺疾病)、麻醉科、皮肤科、呼吸内科、耳鼻咽喉头颈外科、急诊科、中医科等10个学科为国家临床重点专科；小儿外科、肿瘤病院、心血管病院、神经病院4个国家重大疾病多学科合作诊疗能力建设项目；陕西省生物与转化医学工程研究中心、陕西省胃肠动力疾病研究重点实验室2个省级工程中心和重点实验室；皮肤科、消化内科、医用超声研究室、小儿外科、急诊科、手术室、康复医学科、泌尿外科、供应科等9个省级医疗质控中心。
医院是首批国家临床教学培训示范中心，临床技能实验教学示范中心，设有17个学科系、2个教研室。承担着博士后、博士、硕士、本科生、留学生多个层次的教学培养任务和国家继续医学教育项目、陕西省全科医师培训工作，培养的上万名高级医学人才遍及全国各地及世界。承担国家卫生部高等医药院校统编教材编修任务，获得数十项国家、省部级教学成果奖和现代教育技术成果奖。现为“临床技能实验教学示范中心”、全国“住院医师规范化培训基地”“专科医师规范化培训制度试点基地”，陕西省“研究生示范性联合培养基地”。
为了满足人民群众不断增长的就医需求，突破老城区医院物理空间发展受限的瓶颈，医院提出以院本部为中心，“压旧扩新”、优质医疗资源向周边辐射扩展的发展战略，清晰绘制出“一院多区”蓝图框架及国家区域医疗中心技术输出洛阳医院、新疆医院、杨凌示范区医院，实现与主院区各个专业的同质拓展。